Protein–RNA interactions for Protein: Q96E17

RAB3C, Ras-related protein Rab-3C, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3CQ96E17 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RAB3CQ96E17 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RAB3CQ96E17 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RAB3CQ96E17 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RAB3CQ96E17 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RAB3CQ96E17 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
RAB3CQ96E17 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RAB3CQ96E17 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RAB3CQ96E17 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RAB3CQ96E17 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RAB3CQ96E17 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RAB3CQ96E17 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RAB3CQ96E17 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RAB3CQ96E17 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RAB3CQ96E17 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
RAB3CQ96E17 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RAB3CQ96E17 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RAB3CQ96E17 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RAB3CQ96E17 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
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