Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ATG4CQ96DT6 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ATG4CQ96DT6 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ATG4CQ96DT6 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ATG4CQ96DT6 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ATG4CQ96DT6 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ATG4CQ96DT6 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ATG4CQ96DT6 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ATG4CQ96DT6 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
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ATG4CQ96DT6 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATG4CQ96DT6 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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