Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC-1.34□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-1.36□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC-1.38□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.38□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC-1.39□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
RTL8BQ17RB0 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
RTL8BQ17RB0 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
RTL8BQ17RB0 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
RTL8BQ17RB0 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
RTL8BQ17RB0 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
RTL8BQ17RB0 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
RTL8BQ17RB0 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
RTL8BQ17RB0 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
RTL8BQ17RB0 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
RTL8BQ17RB0 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
RTL8BQ17RB0 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
RTL8BQ17RB0 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
RTL8BQ17RB0 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
RTL8BQ17RB0 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
RTL8BQ17RB0 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
RTL8BQ17RB0 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.4 ms