Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPROQ16827 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPROQ16827 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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