Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
FXNQ16595 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FXNQ16595 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FXNQ16595 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FXNQ16595 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FXNQ16595 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FXNQ16595 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FXNQ16595 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FXNQ16595 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FXNQ16595 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FXNQ16595 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
FXNQ16595 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
FXNQ16595 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FXNQ16595 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FXNQ16595 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FXNQ16595 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FXNQ16595 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FXNQ16595 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FXNQ16595 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
FXNQ16595 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FXNQ16595 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FXNQ16595 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FXNQ16595 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FXNQ16595 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FXNQ16595 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FXNQ16595 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FXNQ16595 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FXNQ16595 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FXNQ16595 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FXNQ16595 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FXNQ16595 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FXNQ16595 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FXNQ16595 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
FXNQ16595 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FXNQ16595 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
FXNQ16595 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FXNQ16595 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FXNQ16595 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FXNQ16595 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FXNQ16595 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FXNQ16595 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
FXNQ16595 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FXNQ16595 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FXNQ16595 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FXNQ16595 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FXNQ16595 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FXNQ16595 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FXNQ16595 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FXNQ16595 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FXNQ16595 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FXNQ16595 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FXNQ16595 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FXNQ16595 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FXNQ16595 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
FXNQ16595 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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FXNQ16595 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FXNQ16595 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FXNQ16595 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FXNQ16595 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FXNQ16595 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FXNQ16595 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FXNQ16595 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FXNQ16595 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FXNQ16595 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
FXNQ16595 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FXNQ16595 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FXNQ16595 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FXNQ16595 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FXNQ16595 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
FXNQ16595 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
FXNQ16595 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
FXNQ16595 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FXNQ16595 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FXNQ16595 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FXNQ16595 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FXNQ16595 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FXNQ16595 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FXNQ16595 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FXNQ16595 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FXNQ16595 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FXNQ16595 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FXNQ16595 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FXNQ16595 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FXNQ16595 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FXNQ16595 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FXNQ16595 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FXNQ16595 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FXNQ16595 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FXNQ16595 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FXNQ16595 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FXNQ16595 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
FXNQ16595 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FXNQ16595 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FXNQ16595 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FXNQ16595 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FXNQ16595 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FXNQ16595 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FXNQ16595 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
FXNQ16595 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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