Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SSX2Q16385 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SSX2Q16385 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SSX2Q16385 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SSX2Q16385 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SSX2Q16385 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SSX2Q16385 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SSX2Q16385 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SSX2Q16385 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SSX2Q16385 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SSX2Q16385 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SSX2Q16385 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SSX2Q16385 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SSX2Q16385 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SSX2Q16385 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SSX2Q16385 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SSX2Q16385 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.33□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SSX2Q16385 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SSX2Q16385 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SSX2Q16385 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SSX2Q16385 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SSX2Q16385 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SSX2Q16385 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SSX2Q16385 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SSX2Q16385 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SSX2Q16385 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SSX2Q16385 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SSX2Q16385 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SSX2Q16385 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
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