RNAct
Search
Pairwise
Browse
Proteins
RNAs
Download
About
Search
Protein–RNA interactions for Protein: Q16384
SSX1, Protein SSX1, human
Predictions only
Length
188 aa
.
Download Table
Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
SSX1
Q16384
RNU6-277P-201
ENST00000516272
106 nt
BASIC
-0.27
□□□□□ -2.45
SSX1
Q16384
RNU6-1232P-201
ENST00000516299
86 nt
BASIC
-0.27
□□□□□ -2.45
SSX1
Q16384
SNORA20.3-201
ENST00000516880
132 nt
BASIC
-0.27
□□□□□ -2.45
SSX1
Q16384
AP003733.2-201
ENST00000529409
171 nt
BASIC
-0.27
□□□□□ -2.45
SSX1
Q16384
MIR4752-201
ENST00000579672
72 nt
BASIC
-0.27
□□□□□ -2.45
SSX1
Q16384
AC244669.1-204
ENST00000621564
178 nt
BASIC
-0.27
□□□□□ -2.45
SSX1
Q16384
Y_RNA.66-201
ENST00000362862
102 nt
BASIC
-0.28
□□□□□ -2.45
SSX1
Q16384
SNORD113-8-201
ENST00000363497
74 nt
BASIC
-0.28
□□□□□ -2.45
SSX1
Q16384
Y_RNA.187-201
ENST00000363918
113 nt
BASIC
-0.28
□□□□□ -2.45
SSX1
Q16384
RNU6-1189P-201
ENST00000383958
107 nt
BASIC
-0.28
□□□□□ -2.45
SSX1
Q16384
Y_RNA.424-201
ENST00000384063
103 nt
BASIC
-0.28
□□□□□ -2.45
SSX1
Q16384
RNU6-514P-201
ENST00000384208
107 nt
BASIC
-0.28
□□□□□ -2.45
SSX1
Q16384
Y_RNA.526-201
ENST00000384572
110 nt
BASIC
-0.28
□□□□□ -2.45
SSX1
Q16384
RNA5SP261-201
ENST00000410536
106 nt
BASIC
-0.28
□□□□□ -2.45
SSX1
Q16384
HSPE1P25-201
ENST00000455484
251 nt
BASIC
-0.28
□□□□□ -2.45
SSX1
Q16384
MIR1273G-201
ENST00000577677
100 nt
BASIC
-0.28
□□□□□ -2.45
SSX1
Q16384
RNU1-29P-201
ENST00000606574
126 nt
BASIC
-0.28
□□□□□ -2.45
SSX1
Q16384
MIR1295B-201
ENST00000636144
60 nt
BASIC
-0.28
□□□□□ -2.45
SSX1
Q16384
MIR302B-201
ENST00000362188
73 nt
BASIC
-0.29
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
Y_RNA.252-201
ENST00000364556
101 nt
BASIC
-0.29
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
RNU6-102P-201
ENST00000384485
104 nt
BASIC
-0.29
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
Y_RNA.539-201
ENST00000384635
107 nt
BASIC
-0.29
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
RNU6-535P-201
ENST00000384722
107 nt
BASIC
-0.29
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
MIR215-201
ENST00000384858
110 nt
BASIC
-0.29
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
RNU7-152P-201
ENST00000458982
64 nt
BASIC
-0.29
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
Y_RNA.661-201
ENST00000516003
99 nt
BASIC
-0.29
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
RNU6-1046P-201
ENST00000516538
107 nt
BASIC
-0.29
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
RNU6ATAC22P-201
ENST00000516794
89 nt
BASIC
-0.29
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
Y_RNA.715-201
ENST00000517082
110 nt
BASIC
-0.29
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
AC141846.1-201
ENST00000568348
142 nt
BASIC
-0.29
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
MTND5P34-201
ENST00000568888
325 nt
BASIC
-0.29
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
MIR8087-201
ENST00000612745
78 nt
BASIC
-0.29
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
AC084781.2-201
ENST00000615568
161 nt
BASIC
-0.29
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
Y_RNA.293-201
ENST00000364908
93 nt
BASIC
-0.3
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
RNU6-716P-201
ENST00000365621
103 nt
BASIC
-0.3
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
Y_RNA.430-201
ENST00000384081
110 nt
BASIC
-0.3
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
SNORA72.6-201
ENST00000384520
129 nt
BASIC
-0.3
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
Y_RNA.569-201
ENST00000384749
103 nt
BASIC
-0.3
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
AL035258.1-201
ENST00000439450
439 nt
TSL 3
BASIC
-0.3
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
NDUFAF4P4-201
ENST00000454883
502 nt
BASIC
-0.3
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
Y_RNA.697-201
ENST00000516776
113 nt
BASIC
-0.3
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
AC040926.1-201
ENST00000530195
238 nt
BASIC
-0.3
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
MIR3152-201
ENST00000579801
74 nt
BASIC
-0.3
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
AL133255.1-201
ENST00000606374
441 nt
BASIC
-0.3
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
AC093783.1-201
ENST00000612976
329 nt
BASIC
-0.3
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
Y_RNA.5-201
ENST00000362334
102 nt
BASIC
-0.31
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
RNU6-1272P-201
ENST00000362776
107 nt
BASIC
-0.31
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
Y_RNA.351-201
ENST00000365436
96 nt
BASIC
-0.31
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
MIR526A2-201
ENST00000390198
65 nt
BASIC
-0.31
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
TRAJ48-201
ENST00000390489
63 nt
APPRIS P1
BASIC
-0.31
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
PMCHL1-202
ENST00000423102
261 nt
BASIC
-0.31
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
AL358176.2-201
ENST00000425769
204 nt
BASIC
-0.31
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
LINC01691-201
ENST00000450546
426 nt
TSL 5
BASIC
-0.31
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
RNU7-159P-201
ENST00000459284
62 nt
BASIC
-0.31
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
AC138869.1-201
ENST00000568623
124 nt
BASIC
-0.31
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
Y_RNA.384-201
ENST00000383909
102 nt
BASIC
-0.32
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
RNU6-949P-201
ENST00000384040
107 nt
BASIC
-0.32
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
RNU6-269P-201
ENST00000391077
97 nt
BASIC
-0.32
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
MIR1197-201
ENST00000408818
88 nt
BASIC
-0.32
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
Y_RNA.602-201
ENST00000410535
92 nt
BASIC
-0.32
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
RNU7-165P-201
ENST00000458864
60 nt
BASIC
-0.32
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
AC104692.1-201
ENST00000472406
90 nt
BASIC
-0.32
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
MIR5688-201
ENST00000580619
83 nt
BASIC
-0.32
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
AC007485.1-201
ENST00000616755
206 nt
BASIC
-0.32
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
CDKN3-212
ENST00000620759
196 nt
TSL 5
BASIC
-0.32
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
Clostridiales-1.4-201
ENST00000636807
150 nt
BASIC
-0.32
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
RNU4-90P-201
ENST00000362773
141 nt
BASIC
-0.33
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
RNU6-161P-201
ENST00000363051
106 nt
BASIC
-0.33
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
RNU6-652P-201
ENST00000365488
107 nt
BASIC
-0.33
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
Y_RNA.380-201
ENST00000365663
111 nt
BASIC
-0.33
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
Y_RNA.508-201
ENST00000384502
114 nt
BASIC
-0.33
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
Y_RNA.639-201
ENST00000458981
102 nt
BASIC
-0.33
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
SNORA25.16-201
ENST00000516741
121 nt
BASIC
-0.33
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
AC135050.6-201
ENST00000610813
528 nt
TSL 3
BASIC
-0.33
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
MIR376A1-201
ENST00000616574
68 nt
BASIC
-0.33
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
Y_RNA.91-201
ENST00000363042
107 nt
BASIC
-0.34
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
RNU4-10P-201
ENST00000364383
140 nt
BASIC
-0.34
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
Y_RNA.269-201
ENST00000364685
89 nt
BASIC
-0.34
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
Y_RNA.634-201
ENST00000364811
113 nt
BASIC
-0.34
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
Y_RNA.355-201
ENST00000365462
98 nt
BASIC
-0.34
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
SNORD115-46-201
ENST00000390982
71 nt
BASIC
-0.34
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
RNU6-1203P-201
ENST00000410703
110 nt
BASIC
-0.34
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
AC098614.3-201
ENST00000438957
440 nt
BASIC
-0.34
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
AC068658.1-201
ENST00000507509
388 nt
TSL 2
BASIC
-0.34
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
RNU6-507P-201
ENST00000516045
100 nt
BASIC
-0.34
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
Y_RNA.802-201
ENST00000614892
130 nt
BASIC
-0.34
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
MIR376A2-201
ENST00000636782
80 nt
BASIC
-0.34
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
MIR1302-1-201
ENST00000637932
143 nt
BASIC
-0.34
□□□□□ -2.46
SSX1
Q16384
Y_RNA.248-201
ENST00000364501
109 nt
BASIC
-0.35
□□□□□ -2.47
SSX1
Q16384
Y_RNA.303-201
ENST00000364998
94 nt
BASIC
-0.35
□□□□□ -2.47
SSX1
Q16384
RNU6-484P-201
ENST00000384016
107 nt
BASIC
-0.35
□□□□□ -2.47
SSX1
Q16384
MIR613-201
ENST00000385248
95 nt
BASIC
-0.35
□□□□□ -2.47
SSX1
Q16384
MIR501-201
ENST00000390204
84 nt
BASIC
-0.35
□□□□□ -2.47
SSX1
Q16384
RNU2-55P-201
ENST00000411146
174 nt
BASIC
-0.35
□□□□□ -2.47
SSX1
Q16384
RNU7-80P-201
ENST00000459562
61 nt
BASIC
-0.35
□□□□□ -2.47
SSX1
Q16384
RNU6-1299P-201
ENST00000516316
100 nt
BASIC
-0.35
□□□□□ -2.47
SSX1
Q16384
AL596211.1-201
ENST00000569873
2277 nt
BASIC
-0.35
□□□□□ -2.47
SSX1
Q16384
Y_RNA.142-201
ENST00000363491
102 nt
BASIC
-0.36
□□□□□ -2.47
SSX1
Q16384
RNA5SP245-201
ENST00000364239
121 nt
BASIC
-0.36
□□□□□ -2.47
SSX1
Q16384
Y_RNA.229-201
ENST00000364347
113 nt
BASIC
-0.36
□□□□□ -2.47
First
Previous
967
Next
Last
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.9 ms