Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SSX1Q16384 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SSX1Q16384 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SSX1Q16384 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SSX1Q16384 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SSX1Q16384 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SSX1Q16384 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SSX1Q16384 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SSX1Q16384 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SSX1Q16384 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SSX1Q16384 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SSX1Q16384 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SSX1Q16384 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SSX1Q16384 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SSX1Q16384 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SSX1Q16384 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SSX1Q16384 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SSX1Q16384 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SSX1Q16384 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SSX1Q16384 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SSX1Q16384 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
SSX1Q16384 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SSX1Q16384 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SSX1Q16384 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SSX1Q16384 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SSX1Q16384 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SSX1Q16384 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SSX1Q16384 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SSX1Q16384 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SSX1Q16384 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SSX1Q16384 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SSX1Q16384 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
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SSX1Q16384 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SSX1Q16384 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
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SSX1Q16384 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
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SSX1Q16384 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SSX1Q16384 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SSX1Q16384 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SSX1Q16384 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
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SSX1Q16384 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
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SSX1Q16384 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
SSX1Q16384 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SSX1Q16384 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
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SSX1Q16384 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SSX1Q16384 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
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SSX1Q16384 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SSX1Q16384 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
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