Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TWIST1Q15672 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
TWIST1Q15672 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TWIST1Q15672 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TWIST1Q15672 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
TWIST1Q15672 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TWIST1Q15672 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TWIST1Q15672 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TWIST1Q15672 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TWIST1Q15672 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TWIST1Q15672 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TWIST1Q15672 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TWIST1Q15672 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TWIST1Q15672 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TWIST1Q15672 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TWIST1Q15672 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TWIST1Q15672 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TWIST1Q15672 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TWIST1Q15672 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TWIST1Q15672 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TWIST1Q15672 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TWIST1Q15672 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TWIST1Q15672 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TWIST1Q15672 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TWIST1Q15672 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TWIST1Q15672 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms