Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRIP4Q15650 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRIP4Q15650 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRIP4Q15650 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRIP4Q15650 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRIP4Q15650 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRIP4Q15650 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRIP4Q15650 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRIP4Q15650 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
TRIP4Q15650 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRIP4Q15650 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRIP4Q15650 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRIP4Q15650 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRIP4Q15650 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRIP4Q15650 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRIP4Q15650 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRIP4Q15650 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRIP4Q15650 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRIP4Q15650 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRIP4Q15650 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRIP4Q15650 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRIP4Q15650 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TRIP4Q15650 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRIP4Q15650 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRIP4Q15650 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRIP4Q15650 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRIP4Q15650 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
TRIP4Q15650 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIP4Q15650 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIP4Q15650 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIP4Q15650 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIP4Q15650 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIP4Q15650 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIP4Q15650 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIP4Q15650 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIP4Q15650 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIP4Q15650 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIP4Q15650 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIP4Q15650 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIP4Q15650 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIP4Q15650 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRIP4Q15650 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.6 ms