Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
POLD3Q15054 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
POLD3Q15054 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171 ms