Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNX17Q15036 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNX17Q15036 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNX17Q15036 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNX17Q15036 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNX17Q15036 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNX17Q15036 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNX17Q15036 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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SNX17Q15036 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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SNX17Q15036 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNX17Q15036 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SNX17Q15036 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNX17Q15036 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNX17Q15036 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNX17Q15036 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SNX17Q15036 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SNX17Q15036 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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SNX17Q15036 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNX17Q15036 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNX17Q15036 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SNX17Q15036 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SNX17Q15036 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
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SNX17Q15036 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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SNX17Q15036 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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SNX17Q15036 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
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SNX17Q15036 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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