Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SHPRHQ149N8 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC-2.1□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC-2.12□□□□□ -2.75
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SHPRHQ149N8 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
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SHPRHQ149N8 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
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SHPRHQ149N8 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
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SHPRHQ149N8 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC-2.14□□□□□ -2.75
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SHPRHQ149N8 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC-2.15□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SHPRHQ149N8 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-2.16□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC-2.17□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC-2.18□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
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