Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
COL9A3Q14050 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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