Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SMAD4Q13485 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMAD4Q13485 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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