Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
SGCGQ13326 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
SGCGQ13326 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SGCGQ13326 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SGCGQ13326 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SGCGQ13326 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SGCGQ13326 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SGCGQ13326 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SGCGQ13326 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SGCGQ13326 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SGCGQ13326 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SGCGQ13326 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SGCGQ13326 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SGCGQ13326 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SGCGQ13326 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 207.5 ms