Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SEMA3BQ13214 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SEMA3BQ13214 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SEMA3BQ13214 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SEMA3BQ13214 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SEMA3BQ13214 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SEMA3BQ13214 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SEMA3BQ13214 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SEMA3BQ13214 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SEMA3BQ13214 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SEMA3BQ13214 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SEMA3BQ13214 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SEMA3BQ13214 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SEMA3BQ13214 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SEMA3BQ13214 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SEMA3BQ13214 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
SEMA3BQ13214 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SEMA3BQ13214 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SEMA3BQ13214 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SEMA3BQ13214 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SEMA3BQ13214 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SEMA3BQ13214 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SEMA3BQ13214 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SEMA3BQ13214 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SEMA3BQ13214 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SEMA3BQ13214 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SEMA3BQ13214 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SEMA3BQ13214 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SEMA3BQ13214 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SEMA3BQ13214 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SEMA3BQ13214 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SEMA3BQ13214 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SEMA3BQ13214 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SEMA3BQ13214 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SEMA3BQ13214 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SEMA3BQ13214 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SEMA3BQ13214 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SEMA3BQ13214 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SEMA3BQ13214 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 224 ms