Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PRDM2Q13029 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PRDM2Q13029 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PRDM2Q13029 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PRDM2Q13029 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PRDM2Q13029 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PRDM2Q13029 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PRDM2Q13029 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PRDM2Q13029 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PRDM2Q13029 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC-1.53□□□□□ -2.65
PRDM2Q13029 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PRDM2Q13029 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-1.53□□□□□ -2.65
PRDM2Q13029 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PRDM2Q13029 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC-1.54□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC-1.54□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-1.54□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.55□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC-1.56□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PRDM2Q13029 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PRDM2Q13029 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PRDM2Q13029 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PRDM2Q13029 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PRDM2Q13029 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PRDM2Q13029 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PRDM2Q13029 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PRDM2Q13029 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PRDM2Q13029 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-1.6□□□□□ -2.67
PRDM2Q13029 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PRDM2Q13029 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PRDM2Q13029 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PRDM2Q13029 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PRDM2Q13029 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PRDM2Q13029 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PRDM2Q13029 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PRDM2Q13029 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PRDM2Q13029 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PRDM2Q13029 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PRDM2Q13029 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC-1.61□□□□□ -2.67
PRDM2Q13029 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PRDM2Q13029 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PRDM2Q13029 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
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