Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LMAN2Q12907 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LMAN2Q12907 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LMAN2Q12907 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LMAN2Q12907 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LMAN2Q12907 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LMAN2Q12907 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LMAN2Q12907 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LMAN2Q12907 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LMAN2Q12907 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LMAN2Q12907 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LMAN2Q12907 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LMAN2Q12907 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LMAN2Q12907 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LMAN2Q12907 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LMAN2Q12907 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LMAN2Q12907 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LMAN2Q12907 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LMAN2Q12907 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LMAN2Q12907 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LMAN2Q12907 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LMAN2Q12907 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LMAN2Q12907 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LMAN2Q12907 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LMAN2Q12907 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LMAN2Q12907 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LMAN2Q12907 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LMAN2Q12907 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
LMAN2Q12907 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LMAN2Q12907 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
LMAN2Q12907 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LMAN2Q12907 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
LMAN2Q12907 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
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