Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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RABGGTBP53611 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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RABGGTBP53611 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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RABGGTBP53611 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RABGGTBP53611 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
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RABGGTBP53611 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RABGGTBP53611 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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RABGGTBP53611 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RABGGTBP53611 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RABGGTBP53611 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RABGGTBP53611 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RABGGTBP53611 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RABGGTBP53611 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RABGGTBP53611 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RABGGTBP53611 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RABGGTBP53611 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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RABGGTBP53611 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RABGGTBP53611 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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RABGGTBP53611 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
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RABGGTBP53611 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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RABGGTBP53611 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
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RABGGTBP53611 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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RABGGTBP53611 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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