Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ERFP50548 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ERFP50548 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
ERFP50548 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ERFP50548 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ERFP50548 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ERFP50548 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ERFP50548 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ERFP50548 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ERFP50548 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ERFP50548 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
ERFP50548 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ERFP50548 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ERFP50548 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ERFP50548 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ERFP50548 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ERFP50548 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ERFP50548 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ERFP50548 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ERFP50548 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
ERFP50548 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ERFP50548 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ERFP50548 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ERFP50548 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ERFP50548 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ERFP50548 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ERFP50548 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
ERFP50548 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ERFP50548 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
ERFP50548 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ERFP50548 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ERFP50548 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ERFP50548 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ERFP50548 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
ERFP50548 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
ERFP50548 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ERFP50548 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ERFP50548 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ERFP50548 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
ERFP50548 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ERFP50548 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ERFP50548 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ERFP50548 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ERFP50548 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ERFP50548 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ERFP50548 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ERFP50548 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ERFP50548 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ERFP50548 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ERFP50548 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ERFP50548 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ERFP50548 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
ERFP50548 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ERFP50548 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ERFP50548 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ERFP50548 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ERFP50548 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ERFP50548 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ERFP50548 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ERFP50548 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ERFP50548 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ERFP50548 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ERFP50548 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
ERFP50548 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ERFP50548 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ERFP50548 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ERFP50548 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ERFP50548 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ERFP50548 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ERFP50548 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ERFP50548 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ERFP50548 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ERFP50548 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ERFP50548 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ERFP50548 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ERFP50548 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ERFP50548 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ERFP50548 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ERFP50548 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ERFP50548 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ERFP50548 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ERFP50548 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ERFP50548 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ERFP50548 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ERFP50548 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ERFP50548 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ERFP50548 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ERFP50548 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ERFP50548 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ERFP50548 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ERFP50548 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ERFP50548 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ERFP50548 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ERFP50548 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ERFP50548 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ERFP50548 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ERFP50548 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ERFP50548 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ERFP50548 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ERFP50548 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
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