Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PITX3O75364 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PITX3O75364 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PITX3O75364 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PITX3O75364 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PITX3O75364 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PITX3O75364 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PITX3O75364 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PITX3O75364 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PITX3O75364 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PITX3O75364 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PITX3O75364 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PITX3O75364 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PITX3O75364 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PITX3O75364 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PITX3O75364 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PITX3O75364 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PITX3O75364 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PITX3O75364 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PITX3O75364 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PITX3O75364 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PITX3O75364 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PITX3O75364 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PITX3O75364 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PITX3O75364 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PITX3O75364 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PITX3O75364 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PITX3O75364 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PITX3O75364 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PITX3O75364 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PITX3O75364 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PITX3O75364 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PITX3O75364 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PITX3O75364 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PITX3O75364 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PITX3O75364 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PITX3O75364 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PITX3O75364 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PITX3O75364 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PITX3O75364 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PITX3O75364 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC-1.61□□□□□ -2.67
PITX3O75364 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PITX3O75364 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PITX3O75364 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PITX3O75364 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PITX3O75364 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PITX3O75364 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PITX3O75364 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PITX3O75364 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PITX3O75364 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PITX3O75364 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PITX3O75364 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PITX3O75364 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PITX3O75364 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC-1.62□□□□□ -2.67
PITX3O75364 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PITX3O75364 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PITX3O75364 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PITX3O75364 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PITX3O75364 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PITX3O75364 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.62□□□□□ -2.67
PITX3O75364 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PITX3O75364 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PITX3O75364 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PITX3O75364 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PITX3O75364 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PITX3O75364 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PITX3O75364 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PITX3O75364 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
PITX3O75364 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PITX3O75364 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PITX3O75364 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PITX3O75364 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PITX3O75364 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PITX3O75364 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PITX3O75364 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PITX3O75364 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PITX3O75364 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PITX3O75364 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PITX3O75364 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PITX3O75364 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PITX3O75364 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PITX3O75364 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PITX3O75364 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC-1.64□□□□□ -2.67
PITX3O75364 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PITX3O75364 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PITX3O75364 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PITX3O75364 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PITX3O75364 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PITX3O75364 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PITX3O75364 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PITX3O75364 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PITX3O75364 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC-1.65□□□□□ -2.67
PITX3O75364 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PITX3O75364 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PITX3O75364 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PITX3O75364 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PITX3O75364 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC-1.66□□□□□ -2.68
PITX3O75364 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-1.66□□□□□ -2.68
PITX3O75364 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PITX3O75364 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.5 ms