Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CTIFO43310 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CTIFO43310 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CTIFO43310 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
CTIFO43310 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CTIFO43310 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CTIFO43310 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CTIFO43310 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CTIFO43310 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CTIFO43310 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CTIFO43310 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CTIFO43310 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CTIFO43310 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CTIFO43310 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CTIFO43310 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CTIFO43310 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CTIFO43310 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CTIFO43310 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CTIFO43310 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CTIFO43310 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CTIFO43310 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CTIFO43310 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CTIFO43310 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CTIFO43310 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CTIFO43310 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CTIFO43310 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CTIFO43310 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CTIFO43310 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CTIFO43310 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CTIFO43310 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CTIFO43310 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CTIFO43310 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CTIFO43310 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CTIFO43310 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CTIFO43310 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CTIFO43310 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CTIFO43310 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CTIFO43310 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CTIFO43310 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CTIFO43310 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CTIFO43310 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CTIFO43310 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CTIFO43310 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CTIFO43310 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CTIFO43310 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CTIFO43310 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CTIFO43310 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CTIFO43310 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CTIFO43310 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
CTIFO43310 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CTIFO43310 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CTIFO43310 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CTIFO43310 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CTIFO43310 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CTIFO43310 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CTIFO43310 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CTIFO43310 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CTIFO43310 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CTIFO43310 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CTIFO43310 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CTIFO43310 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CTIFO43310 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CTIFO43310 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CTIFO43310 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CTIFO43310 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CTIFO43310 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CTIFO43310 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CTIFO43310 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CTIFO43310 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CTIFO43310 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CTIFO43310 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CTIFO43310 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CTIFO43310 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CTIFO43310 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CTIFO43310 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CTIFO43310 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CTIFO43310 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CTIFO43310 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CTIFO43310 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CTIFO43310 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CTIFO43310 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
CTIFO43310 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
CTIFO43310 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CTIFO43310 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CTIFO43310 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CTIFO43310 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CTIFO43310 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CTIFO43310 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CTIFO43310 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CTIFO43310 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CTIFO43310 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CTIFO43310 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CTIFO43310 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CTIFO43310 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CTIFO43310 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CTIFO43310 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CTIFO43310 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CTIFO43310 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CTIFO43310 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CTIFO43310 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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