Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-1.74□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC-1.75□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC-1.77□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.77□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC-1.78□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC-1.78□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC-1.79□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC-1.8□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 263.7 ms