Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.1 ms