Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
TRERF1Q96PN7 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TRERF1Q96PN7 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms