Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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ATG4CQ96DT6 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.05
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ATG4CQ96DT6 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ATG4CQ96DT6 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
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ATG4CQ96DT6 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
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ATG4CQ96DT6 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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ATG4CQ96DT6 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ATG4CQ96DT6 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ATG4CQ96DT6 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ATG4CQ96DT6 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ATG4CQ96DT6 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ATG4CQ96DT6 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ATG4CQ96DT6 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ATG4CQ96DT6 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ATG4CQ96DT6 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ATG4CQ96DT6 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ATG4CQ96DT6 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ATG4CQ96DT6 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
ATG4CQ96DT6 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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