Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP53Q70EK8 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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USP53Q70EK8 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
USP53Q70EK8 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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USP53Q70EK8 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
USP53Q70EK8 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
USP53Q70EK8 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
USP53Q70EK8 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
USP53Q70EK8 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
USP53Q70EK8 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
USP53Q70EK8 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
USP53Q70EK8 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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USP53Q70EK8 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
USP53Q70EK8 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
USP53Q70EK8 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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USP53Q70EK8 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
USP53Q70EK8 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
USP53Q70EK8 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
USP53Q70EK8 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
USP53Q70EK8 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
USP53Q70EK8 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
USP53Q70EK8 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
USP53Q70EK8 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
USP53Q70EK8 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
USP53Q70EK8 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2□□□□□ -2.09
USP53Q70EK8 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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