Protein–RNA interactions for Protein: Q16650

TBR1, T-box brain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBR1Q16650 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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