Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CTF1Q16619 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms