Protein–RNA interactions for Protein: Q16558

KCNMB1, Calcium-activated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB1Q16558 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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KCNMB1Q16558 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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KCNMB1Q16558 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KCNMB1Q16558 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KCNMB1Q16558 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KCNMB1Q16558 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KCNMB1Q16558 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KCNMB1Q16558 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KCNMB1Q16558 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KCNMB1Q16558 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KCNMB1Q16558 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KCNMB1Q16558 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KCNMB1Q16558 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KCNMB1Q16558 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KCNMB1Q16558 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KCNMB1Q16558 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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