Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SSX1Q16384 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
SSX1Q16384 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
SSX1Q16384 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SSX1Q16384 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SSX1Q16384 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SSX1Q16384 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SSX1Q16384 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SSX1Q16384 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SSX1Q16384 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SSX1Q16384 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SSX1Q16384 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SSX1Q16384 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SSX1Q16384 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SSX1Q16384 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
SSX1Q16384 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SSX1Q16384 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SSX1Q16384 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SSX1Q16384 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SSX1Q16384 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SSX1Q16384 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.25□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SSX1Q16384 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.7 ms