Protein–RNA interactions for Protein: Q15907

RAB11B, Ras-related protein Rab-11B, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11BQ15907 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.49□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RAB11BQ15907 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RAB11BQ15907 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RAB11BQ15907 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RAB11BQ15907 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RAB11BQ15907 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RAB11BQ15907 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RAB11BQ15907 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RAB11BQ15907 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RAB11BQ15907 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RAB11BQ15907 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RAB11BQ15907 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RAB11BQ15907 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RAB11BQ15907 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RAB11BQ15907 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RAB11BQ15907 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RAB11BQ15907 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RAB11BQ15907 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RAB11BQ15907 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
RAB11BQ15907 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RAB11BQ15907 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RAB11BQ15907 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RAB11BQ15907 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RAB11BQ15907 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RAB11BQ15907 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RAB11BQ15907 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RAB11BQ15907 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
RAB11BQ15907 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RAB11BQ15907 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RAB11BQ15907 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RAB11BQ15907 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RAB11BQ15907 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RAB11BQ15907 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RAB11BQ15907 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RAB11BQ15907 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RAB11BQ15907 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221.6 ms