Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SF1Q15637 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SF1Q15637 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SF1Q15637 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SF1Q15637 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SF1Q15637 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SF1Q15637 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SF1Q15637 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SF1Q15637 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SF1Q15637 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SF1Q15637 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SF1Q15637 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SF1Q15637 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SF1Q15637 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SF1Q15637 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SF1Q15637 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SF1Q15637 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SF1Q15637 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SF1Q15637 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SF1Q15637 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SF1Q15637 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SF1Q15637 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SF1Q15637 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SF1Q15637 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SF1Q15637 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SF1Q15637 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SF1Q15637 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SF1Q15637 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SF1Q15637 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SF1Q15637 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SF1Q15637 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SF1Q15637 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SF1Q15637 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SF1Q15637 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SF1Q15637 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SF1Q15637 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SF1Q15637 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SF1Q15637 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SF1Q15637 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SF1Q15637 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SF1Q15637 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SF1Q15637 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SF1Q15637 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SF1Q15637 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SF1Q15637 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SF1Q15637 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SF1Q15637 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SF1Q15637 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SF1Q15637 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SF1Q15637 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SF1Q15637 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SF1Q15637 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SF1Q15637 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SF1Q15637 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SF1Q15637 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SF1Q15637 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SF1Q15637 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SF1Q15637 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SF1Q15637 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SF1Q15637 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SF1Q15637 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SF1Q15637 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
SF1Q15637 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
SF1Q15637 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SF1Q15637 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SF1Q15637 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SF1Q15637 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SF1Q15637 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SF1Q15637 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SF1Q15637 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SF1Q15637 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SF1Q15637 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SF1Q15637 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SF1Q15637 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SF1Q15637 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SF1Q15637 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SF1Q15637 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SF1Q15637 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SF1Q15637 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SF1Q15637 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SF1Q15637 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SF1Q15637 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SF1Q15637 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SF1Q15637 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SF1Q15637 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SF1Q15637 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SF1Q15637 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SF1Q15637 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SF1Q15637 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SF1Q15637 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SF1Q15637 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
SF1Q15637 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SF1Q15637 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SF1Q15637 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SF1Q15637 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SF1Q15637 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SF1Q15637 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SF1Q15637 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SF1Q15637 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SF1Q15637 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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