Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CKAP5Q14008 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CKAP5Q14008 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CKAP5Q14008 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CKAP5Q14008 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CKAP5Q14008 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CKAP5Q14008 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CKAP5Q14008 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CKAP5Q14008 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CKAP5Q14008 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CKAP5Q14008 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CKAP5Q14008 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CKAP5Q14008 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CKAP5Q14008 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CKAP5Q14008 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CKAP5Q14008 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CKAP5Q14008 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CKAP5Q14008 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CKAP5Q14008 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CKAP5Q14008 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CKAP5Q14008 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CKAP5Q14008 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CKAP5Q14008 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CKAP5Q14008 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CKAP5Q14008 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CKAP5Q14008 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CKAP5Q14008 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CKAP5Q14008 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CKAP5Q14008 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CKAP5Q14008 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CKAP5Q14008 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CKAP5Q14008 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CKAP5Q14008 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CKAP5Q14008 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CKAP5Q14008 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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