Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPSQ13938 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPSQ13938 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPSQ13938 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPSQ13938 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPSQ13938 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPSQ13938 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPSQ13938 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPSQ13938 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPSQ13938 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPSQ13938 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPSQ13938 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPSQ13938 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPSQ13938 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPSQ13938 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPSQ13938 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPSQ13938 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPSQ13938 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
CAPSQ13938 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CAPSQ13938 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CAPSQ13938 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CAPSQ13938 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CAPSQ13938 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CAPSQ13938 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CAPSQ13938 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CAPSQ13938 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CAPSQ13938 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CAPSQ13938 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CAPSQ13938 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CAPSQ13938 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.21
CAPSQ13938 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CAPSQ13938 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CAPSQ13938 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CAPSQ13938 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.5 ms