Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
APOFQ13790 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
APOFQ13790 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
APOFQ13790 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
APOFQ13790 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
APOFQ13790 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
APOFQ13790 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
APOFQ13790 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
APOFQ13790 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
APOFQ13790 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
APOFQ13790 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
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APOFQ13790 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
APOFQ13790 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
APOFQ13790 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
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APOFQ13790 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
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APOFQ13790 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
APOFQ13790 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
APOFQ13790 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
APOFQ13790 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
APOFQ13790 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
APOFQ13790 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
APOFQ13790 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
APOFQ13790 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
APOFQ13790 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
APOFQ13790 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
APOFQ13790 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
APOFQ13790 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
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APOFQ13790 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
APOFQ13790 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
APOFQ13790 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
APOFQ13790 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
APOFQ13790 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.26□□□□□ -2.45
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APOFQ13790 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
APOFQ13790 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
APOFQ13790 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
APOFQ13790 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
APOFQ13790 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
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APOFQ13790 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
APOFQ13790 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
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APOFQ13790 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
APOFQ13790 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
APOFQ13790 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
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APOFQ13790 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
APOFQ13790 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
APOFQ13790 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
APOFQ13790 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
APOFQ13790 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
APOFQ13790 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
APOFQ13790 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
APOFQ13790 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
APOFQ13790 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
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