Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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PTCH1Q13635 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC0.84□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTCH1Q13635 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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