Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CUL3Q13618 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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CUL3Q13618 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.78□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CUL3Q13618 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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