Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNW1Q13573 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNW1Q13573 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNW1Q13573 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNW1Q13573 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNW1Q13573 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNW1Q13573 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SNW1Q13573 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SNW1Q13573 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SNW1Q13573 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SNW1Q13573 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SNW1Q13573 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SNW1Q13573 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SNW1Q13573 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SNW1Q13573 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SNW1Q13573 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SNW1Q13573 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SNW1Q13573 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SNW1Q13573 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SNW1Q13573 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SNW1Q13573 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNW1Q13573 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNW1Q13573 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNW1Q13573 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNW1Q13573 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNW1Q13573 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNW1Q13573 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNW1Q13573 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SNW1Q13573 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNW1Q13573 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SNW1Q13573 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNW1Q13573 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms