Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.33□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC0.33□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.3□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
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RIPK1Q13546 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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RIPK1Q13546 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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