Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
FOXE3Q13461 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXE3Q13461 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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