Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TCOF1Q13428 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TCOF1Q13428 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
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