Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MRPL49Q13405 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms