Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SEMA3FQ13275 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEMA3FQ13275 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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