Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TRIM28Q13263 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM28Q13263 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms