Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
STRN3Q13033 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
STRN3Q13033 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 258.2 ms