Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NFIAQ12857 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NFIAQ12857 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.6 ms