Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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ERVPABLB-1P60509 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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ERVPABLB-1P60509 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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ERVPABLB-1P60509 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
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ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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ERVPABLB-1P60509 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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ERVPABLB-1P60509 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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ERVPABLB-1P60509 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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