Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PGGT1BP53609 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PGGT1BP53609 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PGGT1BP53609 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PGGT1BP53609 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PGGT1BP53609 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PGGT1BP53609 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PGGT1BP53609 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PGGT1BP53609 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PGGT1BP53609 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PGGT1BP53609 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PGGT1BP53609 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PGGT1BP53609 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PGGT1BP53609 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PGGT1BP53609 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PGGT1BP53609 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PGGT1BP53609 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PGGT1BP53609 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PGGT1BP53609 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PGGT1BP53609 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PGGT1BP53609 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PGGT1BP53609 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PGGT1BP53609 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PGGT1BP53609 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PGGT1BP53609 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PGGT1BP53609 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PGGT1BP53609 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PGGT1BP53609 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PGGT1BP53609 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PGGT1BP53609 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PGGT1BP53609 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PGGT1BP53609 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PGGT1BP53609 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PGGT1BP53609 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PGGT1BP53609 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PGGT1BP53609 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms