Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SFTPDP35247 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SFTPDP35247 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SFTPDP35247 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SFTPDP35247 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SFTPDP35247 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SFTPDP35247 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SFTPDP35247 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SFTPDP35247 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.6 ms